Академско образовање и истраживачко искуство др Јелене Ђокић су јој обезбедили изузетно добру основу у више области биологије, укључујући биологију, имунологију, микробиологију и биоинформатику. Током докторских студија бавила се истраживањем механизама деловања мезенхималних матичних ћелија у локалним имунским процесима на Институту за медицинска истраживања Војномедицинске академије. Паралелно с тим, учествовала је у развоју различитих протокола за производњу имунских ћелија за антитуморске вакцине. Након што је докторирала, Јелена се прикључила Групи за пробиотике и интеракције микробиоте и домаћина, где је развијала in vitro моделе за проучавање интеракција између домаћина и бактерија, као и за селекцију млечнокиселинских бактерија (пробиотика) са различитим имуномодулаторним својствима. У наставку свог истраживачког рада заинтересовала се за повезаност између имунског одговора и микробиоте (организама који су осетљиви на кисеоник и који живе у цревима људи и животиња), а откриће да успешност вакцина заснованих на имунским ћелијама против тумора и аутоимунских болести у великој мери зависи од промена у функцији микробиоте је додатно обликовало њену област експертизе. Јелена је тренутно посвећена истраживању повезаности између карактеристика микробиоте и имунског одговора с циљем проналажења нових терапеутских мета за неуроинфламацију која је карактеристична за мултиплу склерозу, али и за Алцхајмерову болест.